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张伟教授团队发布大型藻类高质量质体基因组数据库

发布时间:2026-09-16 浏览次数:

近日,海洋学院张伟教授团队在《Scientific Data》发表题为“A Reference Dataset of 66 High-Quality Plastid Genomes across Three Algal Phyla”的研究论文,系统发布了覆盖绿藻、褐藻、红藻三大门类完整高质量藻类质体基因组数据库,并建立了一套标准化的质体基因组组装与质量评估工作流程。

藻类是海洋初级生产力的核心,质体基因组是研究质体起源进化、光合适应与物种系统发育的关键分子资源。截至2025年11月,全球公开藻类质体基因组仅2878条,覆盖物种不足藻类总数的2%,远落后于陆地植物,高质量标准化资源已成为领域研究瓶颈。

研究团队完成90个质体基因组组装,其中66个为完整闭合环状基因组,涵盖 7 种绿藻、19种褐藻、40种红藻。该数据集新增 29个物种、13个属、4个科、1个目的 NCBI 首次收录序列,大幅拓展了分类覆盖范围;同时建立了组装连续性、准确性、核心基因集完整性三级质控标准,形成可复用的标准化工作流程。

该研究是目前覆盖门类最广、质控标准最严格的藻类质体基因组参考数据集之一,不仅填补了藻类基因组资源的重要空白,也为质体进化、光合适应、藻类系统发育等基础研究提供了可靠的基准数据,将有力支撑海洋藻类多样性、海洋碳汇机制、藻类资源开发利用等方向的深入研究。

目前,组装基因组及注释已提交至 DDBJ/ENA/GenBank 数据库(BioProject 号:PRJEB121163),全部分析数据与配套脚本均在 Figshare 平台公开共享。

附图:本研究发现的三种主要的叶绿体基因组结构及其在90种藻类进化系统中的分布。


论文链接:https://doi.org/10.1038/s41597-026-08310-z


图/文:阚胜龙  审核:姜昭阳